CEToolbox uygulaması kılcal elektroforezi için bir hesap makinesidir. Hidrodinamik enjeksiyon, kılcal damar hacmi, enjeksiyon tapası uzunluğu veya enjekte edilen analit miktarı gibi bileşiklerin ayrılması hakkında birkaç bilgi vermeyi amaçlar. Uygulama her türlü CE sistemi ile çalışmaktadır.
CEToolbox, Java ile geliştirilen ve Apache Lisansı altında yayımlanan ücretsiz bir uygulamadır. Kaynak kodu GitHub web sitesinde mevcuttur. Daha fazla bilgi https://cetoolbox.github.io adresinde bulunabilir.